宮頸納囊絕大多數是子宮頸的生理性變化，子宮頸轉化區內，鱗狀上皮取代柱狀上皮的過程中，新生的鱗狀上皮覆蓋子宮頸腺管口，將腺管開口阻塞，導致腺體分泌物流出受阻，潴留則形成囊腫。此外，子宮頸的局部損傷或慢性炎癥亦可使腺管開口狹窄，導致子宮頸腺體囊腫形成。宮頸囊腫臨床容易診斷，婦科檢查可見子宮頸表面突出單個或多個青白色小囊泡，通常不會自行消失，有時可增大。宮頸囊腫通常無需處理，因為它是一個生理的狀態，但需強調，定期的宮頸癌篩查非常重要。