息肉的治療目前沒有特殊有效的藥物，通常是通過內鏡下的微創的手術來治療，絕大部分的息肉都可以在胃鏡下用微創的方法來進行治療。體積如果不超過1cm的或者是寬基底或者扁平的息肉，通常通過電凝、灼燒的方法就可以；部分小息肉甚至通過活檢鉗就可以直接處理掉；如果是體積比較大的或者帶蒂的息肉，有潛在出血風險，可通過金屬圈套器或者特殊的器械，進行內鏡下的切除或者剝離。這些方法都是目前臨床非常常用、安全、有效的方法。成功率基本上都是100%。