宮腔鏡手術并發癥分為近期并發癥和遠期并發癥。近期并發癥也就是在手術操作的時候出現的并發癥。主要有宮頸損傷、撕裂傷還有子宮穿孔。如果使用宮腔電切鏡有可能傷及大的血管出現手術中出血、感染。另外還有一個極為可怕的術中并發癥就是TURP綜合征，由于手術中切除了子宮表面的一些組織，使它的血管暴露在膨宮液中，這樣就會使大量的膨宮液進入到血液循環系統，使身體產生一系列變化，危重的時候可以危及患者生命，甚至有患者因為行宮腔鏡手術死于手術臺上的報道，所以這個并發癥是宮腔鏡手術最嚴重的手術并發癥。遠期并發癥可以分為繼發感染導致的宮腔粘連、感染、月經異常，甚至閉經。