慢性咽炎病理分為慢性單純性咽炎，主要表現為咽部黏膜慢性充血，黏膜及黏膜下結締組織增生，黏液、黏性分泌物增多。還有一種是慢性肥厚性咽炎，表現為咽部黏膜彌漫性充血、肥厚，黏膜下結締組織、淋巴組織增生，增生以后表現為咽后壁可以看到淋巴濾泡，咽側索增生，即兩側的咽側可以看到條索狀的肥厚、增生、隆起。第三種為干燥性以及萎縮性咽炎，主要是咽部腺體分泌減少，造成了咽部黏膜營養障礙，黏膜干燥甚至黏膜萎縮變薄，此時可在咽后壁看到干痂附著，咽部感覺會減退，即咽反射會減退。雖然慢性咽原因非常多，但其病理表現為黏膜炎癥增生、黏膜功能減退，它是不會發生癌變的，因此大可不必因為咽部異物感、梗阻感而擔憂害怕發生癌變。