甲狀腺功能減退癥的化驗單主要看甲狀腺功能指標，甲狀腺功能當中主要表現為總T3、總T4、游離T3和游離T4，還有促甲狀腺激素(TSH)，通常促甲狀腺激素(TSH)是最先發生變化，也是最敏感的指標。如果促甲狀腺激素(TSH)水平出現明顯升高，總T3、總T4、游離T3、游離T4水平降低，這時候就提示患者存在甲狀腺功能減退癥。但有些患者在早期僅表現為亞臨床甲狀腺功能減退癥，通常只會表現為促甲狀腺激素(TSH)水平的升高，但是總T3、總T4以及游離T3、游離T4可能都是在正常的范圍。針對甲狀腺功能減退癥最敏感的指標雖然是促甲狀腺激素，但是也要結合甲狀腺激素來共同判斷。因為甲狀腺功能減退癥有原發性甲狀腺功能減退癥和繼發性的甲狀腺功能減退癥，不結合甲狀腺激素和促甲狀腺激素共同判斷，有時候會出現判斷的失誤。無論是什么原因導致的甲狀腺功能減退癥，都應該予以左甲狀腺素鈉進行替代治療，最常見的原因是自身免疫性甲狀腺疾病橋本甲狀腺炎。所以針對病因的檢查，通常還可以檢測甲狀腺過氧化物酶抗體以及甲狀腺球蛋白抗體，如果這兩者出現明顯升高，通常提示患者存在橋本甲狀腺炎的可能。