小孩進行核磁共振檢查對身體沒有損害，具體如下：1、核磁共振屬于氫原子成像技術合成影像，并非X線射線，沒有輻射，對小孩沒有影響，較為安全；2、核磁共振一次只能檢查一個部位，所需時間較長，大概每個部位需半小時，小孩年齡小且配合度較差，大部分情況需要口服鎮靜藥物，鎮靜藥物可能對小孩存在影響；3、運動較快的器官不能進行核磁共振檢查，如心臟或腸道、空腔臟器、肺臟等，需進行X線或其他檢查。所以孩子可以放心進行核磁共振，但大部分情況下需要鎮靜，而且每次檢查大部分只能做一個部位，如果做兩個部位，所需要時間可能更長，可能產生一定影響。但如有必要，必須進行核磁共振檢查。