引起心肌水腫的主要原因是心肌細胞炎癥損傷，炎癥反應均會有滲出，因為細胞在炎癥刺激后可能會發生腫脹。細胞外基質可能會有較多炎性因子趨附或者中性粒細胞聚集，導致心肌細胞可能出現滲出、水腫、損傷，甚至后期有纖維結締組織增生、心肌重構，常見于急性心肌炎。無論是感染性心肌炎或理化因素導致的急性心肌炎，心肌細胞膜可能會出現損傷，導致心肌細胞膜通透性發生改變，所以會有心肌細胞酶類或者小分子滲到心肌細胞組織間隙，出現不同程度心肌水腫。尤其是在進行心臟影像學檢查，如心臟彩超或心臟核磁，甚至心臟核素檢查時，會明顯觀察到心內膜下存在炎癥相匹配的心肌水腫部位。