激光點痣原理為利用激光的高能量、高溫將痣細胞直接清化，即燒掉。激光有精準的脈寬，當脈寬窄到一定程度下，作用的熱僅局限在痣細胞處，對周圍健康組織沒有明顯作用，從而達到選擇性的破壞效果，并不遺留坑和疤。激光祛痣并不能1次完全祛除，由于痣的深淺不同，如表皮痣、真皮痣、交界痣，如果激光1次完全祛除，則可能對皮膚基底層造成損傷，同時在傷口愈合后遺留瘢痕。為減少瘢痕形成，通常祛痣只祛到皮膚真皮深層，在即祛痣又不留痕的情況下，多次將痣細胞祛除干凈。由于皮膚的汗腺毛囊中有黑色素細胞遷移，從而容易造成復發痣，因此痣復發后，可再次進行激光祛除。