對于附睪炎，首先要針對炎癥的類型進行分類。常見附睪炎多由于普通細菌感染導致，而部分附睪炎是由于尿道細菌逆行感染引起，并通過前列腺、精囊、射精管引起附睪感染。對于這種附睪炎癥，需要針對性采用對革蘭氏陰性桿菌敏感的藥物，比如左氧氟沙星以及頭孢類藥物進行治療。對于特殊感染所引起的附睪炎，比如非淋性尿道炎引起的附睪炎，這種情況下就需要口服對支原體、衣原體敏感的抗生素。 另外，對于結核引起的附睪炎，需要應用常規抗結核的三聯或四聯藥物進行治療。而除了抗生素的治療之外，對于誘發附睪炎的因素，比如后尿道排尿壓力過高，可能還會通過應用α受體阻滯劑緩解排尿時后尿道的壓力。