藥流不干凈不清宮可能造成胚胎在子宮內長期存留，如果胚胎在子宮內長期存留不及時排出，可能造成胚胎物與宮壁粘連、機化，影響子宮收縮，同時容易造成宮腔內感染。組織殘留存留在子宮內時間過長，還可能激活凝血因子，出現大出血的現象，因此如果藥流已經發現殘留建議及時清除。較小的殘留可以采用藥物進行清除，服用藥物或使用米索前列醇。如果殘留物>2cm時應及時清宮，如果不及時清宮容易造成宮腔感染，同時組織殘留與組織和肌壁結合、機化，造成清宮困難，特別是容易出現清宮時穿孔或出血過多的現象，對女性影響較大，易造成不可挽回的后果，所以應該盡量避免。