尿液檢查細菌升高應考慮有尿路感染的可能，正常尿液中并沒有細菌，如果尿液中出現細菌稱之為細菌尿，可見于尿路感染，常見致病菌為致病性的大腸桿菌。也有一些復雜性尿路感染是由于各種原因造成的細菌感染，如泌尿系統解剖和功能異常、免疫缺陷性疾病等造成其他細菌的感染機會增多，比如變形桿菌、不動桿菌等。尿液中的細菌常常由會陰部的細菌感染引起，會陰部的細菌主要來自腸道和女性陰道，經尿道通過逆行感染的方式而造成下尿路感染，在采取尿液標本時，若尿道外口沾染會陰部，可造成尿液中的細菌出現污染。污染的細菌一般＜10^3/ml，對于介于10^3-10^5/ml的菌落數，則認為可疑感染，需重新進行檢查，同時要結合患者臨床表現綜合分析。另外一種情況是尿中細菌可見于無癥狀性菌尿，無癥狀性菌尿被認為尿液中的細菌數量也＞10^5/ml。但是患者可能沒有癥狀，考慮是致病率比較低的細菌感染造成，對于無癥狀性菌尿，多數患者不需要治療，對于孕婦出現無癥狀性菌尿則需要治療，因為有引起早產的可能。