進行肌電圖檢查，存在一定的痛苦性。肌電圖檢查是有創傷性檢查，在進行肌電圖檢查時，需要將較細的針極刺入肌肉。進行募集電活動時還會要求患者在指令下，進行肌肉收縮動作，此時會增加患者的痛苦，所以肌電圖有一定的創傷性和痛苦性。疼痛的評估有一定主觀性，與個人的敏感程度以及情緒等方面有密切關系，所以不同的人感受到的肌電圖疼痛的程度也不同。可能同一刺激，不同患者的感受不同，疼痛的閾值也不同，所以肌電圖對每個患者痛苦的程度不可一概而論。但是肌電圖檢查對于某些疾病的診斷，尤其是下運動神經異常的診斷，有非常重要的作用。有必要進行肌電圖檢查時，還是要充分考慮利弊，最好是聽從醫生的建議來完成檢查。