近親結婚所生的孩子并不一定會有問題，而是患病的幾率比較高，由于近親結婚生下的孩子來自共同的祖先，攜帶有患病基因的可能性較大。每個人身上都具有患病基因，但人體是否患病，通常由兩個基因位點決定，一個來自父源，另一個來自母源，如果兩個當中有一個屬于正常，另一個屬于異常，這時孩子不會發病。只有兩個同樣的致病基因都遺傳給孩子，這時才會發病。如果近親結婚，孩子的父母攜帶有同樣致病基因的可能性比較高。而非近親結婚，雖然有致病基因，但屬于不同種類的致病基因，所以孩子不會發病。