氣管旁憩室通常不會癌變。氣管憩室為先天性發育畸形，里面均為正常氣管黏膜，上面覆蓋普通柱狀細胞或鱗狀細胞、杯狀細胞。通常無炎癥、污染物長期刺激時不會出現癌變，且癌變率不比正常的氣管黏膜更高。此病與食管旁憩室不同，食管因為經常進食，憩室里面會經常藏有食物，從而引起炎癥刺激等問題，癌變率比氣管旁憩室高。氣管旁憩室會有小孔與氣管相通，進去的是無菌空氣，出來的也為空氣。多數情況下氣管旁憩室里無感染、無慢性炎癥。慢性支氣管炎或慢阻肺患者，可能有感染或積存大量痰液的情況，此時慢性炎癥持續存在，一定時間后可能出現癌變，但幾率極低。