阿莫西林不是牙齦腫痛的首選藥物，單純使用阿莫西林的效果，不如單純使用甲硝唑、替硝唑，更不如聯合使用廣譜抗生素和硝基咪唑類的藥物。通常口腔內感染很多都是厭氧菌感染，首選的是對厭氧菌明顯有效的藥物，如硝基咪唑類的甲硝唑、替硝唑、奧硝唑。此類抗生素對厭氧菌有比較好的抑制效果，克林霉素對厭氧菌有很好的效果。但是口腔中也不僅有厭氧菌感染，可能還會有其他的細菌感染。所以，如果感染比較明顯，可以用兩種抗生素聯用，如甲硝唑、替硝唑等窄譜抗生素，專門對厭氧菌有效的抗生素。另外，再結合一種廣譜抗生素一起使用，比如頭孢。同時，也可以用青霉素族藥物，如阿莫西林和甲硝唑、替硝唑配合使用。或者用大環內酯類的藥物，比如紅霉素、阿奇霉素，也可以和抗厭氧菌的藥物配合使用，這樣效果比較好。