導致龜頭尿道口長肉粒的疾病主要如下：1、尖銳濕疣：出現這種情況最多見的疾病就是尖銳濕疣，主要是人乳頭瘤病毒即HPV感染所致，屬于一種性傳播疾病，患者通常存在不潔的性接觸史，肉粒主要呈小菜花狀，且同時伴有癢痛感。此時可通過涂抹外用軟膏，如吡喹莫特乳膏等進行治療。或者肉粒較大，一般可以通過冷凍、激光、局部注射干擾素或者手術切除等方式進行治療，但應按照較長的療程進行治療，另外男性患者還需檢查肛門周邊、陰囊以及會陰處是否存在此癥狀，應同時進行治療；2、慢性尿道炎：尿路上皮長期的慢性炎癥易導致尿路增生。一方面積極地使用抗生素治療尿道炎，另一方面將新生物進行切除，并通過病理檢查明確診斷，再進行規范治療，一般復發的概率較低。