肚臍眼左邊隱隱作痛的原因主要如下所示：1、左半結腸病變：肚臍眼左邊是降結腸、乙狀結腸，即左半結腸，如果左半結腸出現疾病時，可能會引起隱隱作痛。如左半結腸的炎癥性疾病，包括潰瘍性結腸炎，會出現腹部隱痛，還可能會伴有頻繁排黏液膿血便，一天3-5次，另外左半結腸癌癥，比如降結腸癌、乙狀結腸癌、降結腸腺瘤、乙狀結腸腺瘤，以及降結腸、乙狀結腸息肉等，都可能會造成隱痛，此時應該通過結腸鏡，即從肛門插入直腸，直視下觀察腸道是否存在炎癥性改變，以及腫瘤性病變，必要時可以進行活檢，明確診斷；2、小腸病變：如炎癥性病變，包括克羅恩病、腸結核、非特異性小腸炎癥、腫瘤性病變、間質瘤、淋巴瘤、腺癌等，也會引起隱痛，這時需要進行消化道造影或者小腸鏡檢查明確診斷；3、功能性病變：一般是由于自主神經功能紊亂，引起的腸功能紊亂所導致，此時給予糾正腸功能紊亂的藥物，都會有所效果。