由于技術的有限性，目前骨髓移植可能會對生育有影響，嚴重者可不育。但目前技術較為發達，包括女性可將卵巢組織凍存，骨髓移植后回輸體內，可以滿足女性骨髓移植后的性征發育及保證生育功能。 其它方面影響，如移植后排異反應、心理影響，需不停攻克難關以達最佳療效。所以骨髓移植應做到精準診斷、預處理、用藥、精準供者選擇，將各方面把控好。