感冒時喉嚨痛、全身酸痛，具有不同作用機制，無論流感流行性感冒或普通感冒，感冒病毒進入到機體后，常見寄殖部位為上呼吸道及肺臟。病毒在器官中大量繁殖的時候，可能刺激相應病毒寄生部位，產生不適感，如咽喉酸痛、咽喉疼痛，可能與局部病毒造成的局灶性炎癥有關。當患者感染病毒后，身體出現病毒血癥及由病毒感染造成的內毒素血癥，還會產生致熱源，導致下丘腦體溫中樞出現體溫調定點升高。人體正常體溫為37℃，由于感染源的刺激將體溫調整到38-39℃，身體在逐漸增溫的過程中，需要身體的產熱，包括內臟產熱及骨骼肌產熱，較短時間體溫上升需要骨骼肌參與。骨骼肌在做功、寒戰過程中，使身體出現產熱導致體溫升高。骨骼肌在產熱過程中，可導致肌肉出現酸痛現象。