男性不育首先要做的檢查是精液常規，如果精液異常則需要針對睪丸本身原因，睪丸前因素、睪丸后因素進行相關的檢查，根據具體情況選擇相應的檢查項目。具體的檢查項目包括性激素的檢查、精子DNA碎片分析、免疫學分析如抗精子抗體等、精漿生化分析，有助于判斷生殖道梗阻的位置等，精子頂體功能檢測，泌尿生殖道感染的檢測，如支原體、衣原體、鏈球菌等微生物檢測。睪丸、附睪、精索靜脈、輸精管、精囊B超的檢查，睪丸血管的檢查，遺傳學評估如染色體核型分析Y染色體微缺失、睪丸活檢等。