由于CT掃描速度快，故對于眼部外傷或眼部腫瘤，CT檢查都是首選影像學檢查方法之一。尤其對于眼部外傷病變，CT可以很好觀察眼部外傷之后晶狀體脫離、眼眶骨折，或視神經管骨裂。此外，也可以利用CT檢查觀察眼球異物，比如金屬異物等。但對于玻璃、木屑等異物，CT通常無法進行觀察，因為其密度與軟組織密度相近，CT通常并不能很好的觀察。 對于眼眶或者眼球炎癥，CT和磁共振檢查都可以作為影像學檢查方法之一。對于眶內腫瘤或甲狀腺引起的眼部疾病，可以用磁共振檢查方法進行進一步檢查。