鹽酸莫西沙星片在臨床上不可以用于治療前列腺炎，雖然莫西沙星是最新一代的喹諾酮類抗生素，但主要針對的菌是誘發呼吸道、鼻竇感染的常見致病菌，比如肺炎鏈球菌等。在莫西沙星的說明書上也明確寫著對社區獲得性肺炎及上呼吸道感染有效，里面沒有提及用于治療泌尿和男性生殖系統的感染。在既往的前列腺炎治療中，常用的左氧氟沙星，該藥是治療前列腺炎的首推抗生素之一，主要的原因是它可以覆蓋包括大腸桿菌在內的常見細菌性前列腺炎的致病菌，因此在臨床上有很好的療效。治療一般根據患者的癥狀以及是急性，還是慢性前列腺炎，在療程上可能需3-6周不等，針對慢性前列腺炎患者療程可以適當放長。所以莫西沙星雖然是更高一代、更新一代的喹諾酮，但是在臨床上泌尿男科醫生并不用來治療前列腺炎。