下咽癌通常由耳鼻喉科醫生通過電子鼻咽喉鏡檢查確診，電子鼻咽喉鏡通常從鼻腔進入，經鼻腔、鼻咽、口咽到達下咽及喉部，下咽區域與喉部區域屬同一水平面的前后。在行鼻咽喉鏡同時可發現下咽部及喉部的新生物，達到臨床診斷的目的。 在看到存在新生物時可通過電子鼻咽喉鏡檢查，切除部分腫瘤進行活檢方可確診下咽癌。