尿道感染輕度的患者可以不吃藥，通過大量飲水、大量排尿，可自愈。這些方法做不到治愈的情況下，必須就醫，在醫生指導下用抗菌藥物。患者不要擅自做主，因為多數患者反復發作，還會服用以前經常服用的藥物。但不是每次感染都是同一種細菌引起，所以應該就診分析到底是什么原因引起的感染，特別是較重的感染，通過3天的普通治療不能愈合、不能恢復時，就要分析、做培養，選擇敏感的抗菌素，需要在醫生的指導下進行尿常規、尿培養，做出正確選擇。 常用泌尿道感染藥物治療是喹諾酮類藥物和頭孢類藥物，主要針對常見的大腸桿菌和肺炎桿菌引起的尿道感染。革蘭陽性腸球菌還可以用磷霉素，這也是最近幾年出現的新藥，治療膀胱尿道炎的效果較好。如果這些常規治療效果達不到目的，就要考慮其它細菌感染的可能。往往用過藥的患者，近期做尿路培養都是失敗，因此要求患者停藥1周到10天，在這種狀況下再培養。但是這樣會耽誤時間，因此可以憑經驗性的選擇藥物，即常規用藥失敗的情況下可使用靜脈途徑輸液，選擇氨基糖甙類和β-內酰胺酶類藥物。比如頭孢哌酮、頭孢曲松，這是治療難治性泌尿系感染的措施。