鹽酸帕羅西汀片的副作用常見有胃腸道的不適，如惡心、厭食、腹瀉等，也可出現頭痛、不安、乏力、嗜睡、失眠、頭昏等。少數不良反應可有過敏性的皮疹及性功能減退。突然停藥可見撤藥綜合征，如失眠、焦慮、惡心、嘔吐、胃腸脹氣，還有乏力、性功能障礙，如陽痿、性欲下降等。 有報道服用帕羅西汀片后會產生短暫的血壓改變，這種情況多發生于有潛在高血壓或焦慮患者。但少有心動過速的報道，也曾有發生意識障礙、肝功能異常、異常出血，多為淤血后紫癜、血小板減少的少量報道。多數不良反應強度、頻率隨著患者用藥的時間而降低，通常不影響治療。需要定期抽血化驗、心電圖檢查、長期重大評估用藥物副作用。