月經期間霉菌有可能會加重。治療霉菌的主要藥物是陰道局部用藥，而在月經來潮時通常不能在陰道局部用藥，因此陰道局部的霉菌感染有可能會加重。另外，來月經時通常會有陰道存血，而血本身是非常好的培養基，霉菌很容易在含血的環境下迅猛的繁殖和增長，從而造成炎癥加重。 出現這種情況時，雖然不能應用局部抗真菌的藥物，但可以服用口服藥物進行應對。口服藥對于深部真菌的治療非常有效，也非常必要。在服用口服藥之后，即使在月經期也可以在很大程度上控制霉菌生長和繁殖，從而減少霉菌局部炎癥反應，并減少霉菌引起的不適。治療霉菌雖然局部用藥十分重要，但口服用藥可以減少復發以及減少霉菌的嚴重程度。