對于男性尿道結石，如果在5mm以下，通過多喝水、多活動，大量排尿，大部分結石可以排出。如果不能排出，可以應用部分抗生素，減輕尿道的炎癥水腫，也可以排出。如果依然不能排出，需借助膀胱鏡或輸尿管鏡，經尿道外口觀察尿道內結石后，利用激光進行粉碎并排出體外，也可以利用彈道碎石將結石粉碎以后排出體外，還可以選擇用碎石鉗將結石夾碎以后排出體外。尿道結石不能排出多數由于結石不太光滑，比如草酸鈣結石容易卡在尿道膜部。部分患者伴隨尿道狹窄且既往有尿道擴張治療病史，結石再次沉積在狹窄部位。在治療尿道結石的同時，還應注意將狹窄部分治療，將其切除后進行尿道再吻合，或者擴張尿道狹窄部位以后將結石取出。