胚胎停育后，最早出現的征兆是早孕反應減輕或消失。但是早孕反應本身就因個體差異而不同，所以不能用早孕反應來判斷胚胎是否停孕。大多數孕婦胚胎停育后沒有明顯癥狀，如果發生胎停，母體會出現一系列改變，以利胚胎排出體外。首先是雌孕激素下降，還有血β-HCG明顯下降，孕酮下降，機體對胚胎會產生一些免疫排斥效應，母體和胚胎之間血管形成血栓，然后發生離斷，從而導致陰道出血。在胚胎排出過程中會出現下腹疼痛，這種下腹疼痛往往呈陣發性，當胚胎完排出后，腹痛消失，然后出血減少。