PET-MR與PET-CT相同，是由兩部分組成，一部分是PET，一部分是磁共振即MR。在兩部分內磁共振不帶輻射，只是提供磁場。而PET因為所使用的顯像劑18F-FDG、碳-11它是放射性的同位素，對機體有損傷。 所以PET-MR在檢查時會對患者或短時間內會對周圍公眾，產生一定輻射。但是輻射量是要低于PET-CT的，它的PET的輻射量是一樣的，多出來的部分就是CT的輻射劑量。CT的輻射劑量只是檢查患者所接受的輻射量，而公眾不會受影響。