引起喉嚨吞咽刺痛的原因較多，具體如下：1、咽喉炎癥：如扁桃體炎、急性咽喉炎，以及會厭炎等。當炎癥較明顯時，吞咽疼痛可加劇；2、咽喉潰瘍：尤其在扁桃體形成潰瘍，或咽側壁等部位，有潰瘍時做吞咽運動，可引起明顯刺痛；3、咽喉異物：尤其吃魚，或帶有刺的骨頭后等，均可引起吞咽時刺痛明顯；4、莖突過長：莖突過長也可導致吞咽時有刺痛感，且可能向耳部放射。當喉嚨吞咽有刺痛感時，一定要到醫院就診，通過咽喉鏡的檢查、影像學的檢查，及時發現病因，進行治療。