普通胃鏡只能看到病變表面，對于病變來源及胃腔內外情況觀察不到，通過完善B超檢查，可進一步了解病變來源及與周圍組織關系。如近年來發展出來的超聲內鏡，就是在普通胃鏡基礎上，在胃鏡頭端裝有超聲探頭。其既可以通過內鏡直觀觀察消化道腔內形態，同時又可以進行實時超聲掃描，以獲取管道壁層次的組織學結構特征及周圍鄰近臟器的超聲圖像，從而進一步提高內鏡和超聲的診斷水平。當胃鏡檢查中發現病變時，將超聲內鏡貼上去之后，其可以發射出超聲波，用超聲探頭進行檢查。比如胃黏膜下長有鼓包、腫瘤，可利用超聲胃鏡了解病變深度、起源、腔外情況，這是普通胃鏡無法觀察到的。 此外，在超聲內鏡的介導下，應用細針穿刺抽取活檢，也可明顯提高病變確診率。