對于創傷性口腔潰瘍，在創傷因素去除后，通過使用藥物也可促進潰瘍愈合，如常用的消炎、止痛、促進潰瘍愈合的藥物，如重組人表皮生長因子凝膠、如康復新液，亦或使用中藥進行治療。創傷性口腔潰瘍治療的重點不在于用藥，而是去除創傷因素，對于有殘根殘冠的患者，應及時修復或拔除殘根殘冠。對于有自傷行為的兒童，比如抽動癥患者，需糾正其自傷行為，做到以上幾點，潰瘍不用藥也可愈合，因為人體的修復能力非常強。若創傷因素去除后兩周潰瘍仍不能愈合，應及時前往醫院就診，排除癌性潰瘍病變。很多癌性潰瘍是由創傷因素引起。