乙肝小三陽的治療要根據乙肝病毒復制情況、肝功能、肝臟的形態、是否出現并發癥，來采取定期檢查、飲食控制、對癥藥物和抗病毒治療等。乙肝小三陽屬于乙肝病毒感染的一種狀態，大多數的乙肝感染者是乙肝病毒低復制狀態，就可以表現為乙肝小三陽，抽血檢測乙肝病毒測不出，或者是處于相對較低的水平，肝功能完全正常，稱為乙肝病毒攜帶者。上述情況不需要藥物治療，平時飲食要保證營養均衡，嚴格的戒煙、戒酒，避免勞累熬夜，避免傷肝的藥物以及不良的生活方式、定期檢查，乙肝小三陽可以長期的保持穩定的狀態。如果乙肝病毒活躍復制，同時合并有肝功能的異常，甚至是出現了慢性肝炎、肝纖維化以及肝硬化的表現，這種乙肝病毒則需要盡早的開始抗病毒藥物治療，抗病毒藥物可以控制乙肝病毒的生長和活躍復制，延緩肝臟損傷的進展，在一定程度上降低肝硬化、肝癌的發生。