HPV疫苗的二價和九價區別，主要在于針對的HPV感染類型不同，具體如下：1、二價疫苗：針對HPV-16和HPV-18，這兩型的HPV感染覆蓋大部分的宮頸癌，預防這兩項就預防了大部分的宮頸癌；2、九價疫苗：比二價疫苗的覆蓋范圍更廣，預防低危的感染即HPV-6和HPV-11，這兩型較容易出現尖銳濕疣。還可以預防HPV-31、HPV-33、HPV-45、HPV-52和HPV-58，這五型患宮頸癌的幾率比HPV-16、HPV-18少，但是仍然有可能性。