大腸和小腸的連接處為回盲瓣，在內鏡下可以清楚觀察到解剖的結構，回盲瓣在解剖上形狀類似魚的嘴巴。做膠囊內鏡時，可以看見膠囊順著小腸的蠕動進入結腸，這個過程中可以明顯看到，原來在相對管狀的小腸腸腔里蠕動，有絨毛的結構，突然進入管腔相對較寬大的回盲部。做結腸鏡時逆向的走到回盲瓣口，通過回盲瓣，結腸鏡進一步進入小腸末端，觀察部分的小腸的結構。在回盲瓣旁邊，可以看到闌尾的開口，這整個部分稱為回盲部，這個部分其實就是大腸跟小腸相交的位置。小腸更多的是起食物消化吸收的作用，大腸進一步的重吸收水分，將食物殘渣逐步形成糞便，最終排出體外。