通常藥物流產最終的成功率＞90%，有10%的人最終可能需要選擇做手術清宮。部分患者第一次口服流產藥物，即米索前列醇，當天不一定排出妊娠組織，通常會在第二天加用藥物，可最終成功排出妊娠組織。另外，藥物流產的出血時間通常比人流手術更長，多數為1-2周，最終在2周內徹底干凈，也認為是流產成功。由于藥物流產出血的時間延長，可能繼發感染、不孕等情況，并發癥風險反而更高。目前建議大部分患者在正規的醫院進行人工流產。隨著麻醉技術的全面發展，人工流產的痛苦極大地減少，手術的并發癥比藥物流產更小，對后續的影響也更小。