甲胎蛋白和癌胚抗原是不相同的兩個指標，具體如下：1、甲胎蛋白：也叫AFP，其異常表達可能與體內肝癌的發生有一定相關性，也有部分腫瘤可能提示甲胎蛋白與生殖源性腫瘤有一定相關性，但是并不絕對；2、癌胚抗原：也叫CEA，也是作為血清學腫瘤標志物中常見指標，這個指標升高，不像甲胎蛋白具有相對高的特異性，其特異性相對要差，多數可以見于消化系統腫瘤，比如肝癌、膽道癌、胰腺癌、胃癌、腸癌，可能都會導致該指標的異常表達。除此以外，比如肺部腫瘤或者女性的乳腺癌、婦科腫瘤等，可能也會影響到該指標的表達，因此其特異性欠佳。甲胎蛋白和癌胚抗原同為血清學腫瘤標志物，在診斷上可以作為輔助或者補充的功能，無論這個指標表達的情況高低與否、正常與否，最主要的還是要結合影像學的評估，包括CT或者鏡檢的檢查，來判斷體內是否有腫瘤存在。一旦發現了腫瘤，早期腫瘤應及早給予根治性治療，改善病人預后。