在所有針灸適應證的疾病基礎上，五行針灸都適宜治療，臨床上針灸適應證常見的是失眠，部分患者情緒的障礙、焦慮、抑郁以及疼痛等病變，都可以使用針灸或五行針灸治療。五行針灸起自黃帝內經，中醫認為的五行包括木、火、土、金、水，是在自然界中占主要地位的5種物質。五行針灸在上世紀的中葉傳到歐洲，在歐洲發揚光大，近些年又傳回中國，所以五行針灸在國外應用相對比國內更廣泛。五行針灸與針灸主要的區別是以五行為基礎，針灸常用的是經絡辨證方式，在結合八綱辨證等辨證基礎上采用針灸治療。針灸常見的處方，如肝腎陰虛、足太陰、脾經等問題，之后選擇對應的相關穴位、脾經穴位，都是依據八綱辨證、臟腑氣血、陰陽失調以及經絡辨證來循經取穴。而五行針灸是以五行為根基進行取穴，所以五行針灸在臨床上治療的核心適應證，與普通針灸差別較小，普通針灸能治療的核心疾病，五行針灸也可以治療。