女性在妊娠期的時候，如果罹患滴蟲性陰道炎，涉及一些對于胎兒的致畸影響，目前沒有非常明確的證據表明，滴蟲性陰道炎可以致畸。當然，在臨床上發現的這一類滴蟲性陰道炎，大多數都是及時給予用藥。因為如果長時間沒有用藥，由于滴蟲性陰道炎的炎癥刺激，將會大大增加胎膜早破、宮內感染以及未來發生流產、早產的一些風險。因此，即使是在孕期的時候，如果發現滴蟲性陰道炎，也一定要及時治療，以免由于滴蟲性陰道炎本身發生了妊娠的不良結局。另外，也有部分女性在妊娠期感染了毛滴蟲之后，可能會對用藥有一定的顧慮。但是用藥與不用藥的利和弊相比，并沒有發現應用了硝基咪唑類這類的藥物有明顯的致畸作用。盡管這一類的藥物確實是會通過胎盤，但是與不用藥相比，所導致的宮內感染、胎膜早破、流產、早產，甚至導致感染擴散等這一類非常嚴重的并發癥相比，肯定用藥相對而言所造成的危害會更低。因此，在妊娠期的時候，已經診斷為滴蟲性陰道炎，還是需要立即給予及時用藥，以免發生不良妊娠結局。