泌尿系感染用的抗菌素主要是廣譜抗菌素，絕大多數情況下會用喹諾酮類抗菌素，目前用得比較多的是左氧氟沙星這類。也可以用頭孢類抗菌素，如頭孢他啶、頭孢克洛、頭孢地尼。臨床上，泌尿系感染具體選用藥物時，會經驗性用上述的廣譜抗菌素。一般不會將所有懷疑泌尿系感染的病人，都做尿細菌培養、藥物敏感試驗。等到細菌培養的結果出來，根據藥物敏感的情況，再具體選用敏感的抗菌素，在絕大多數臨床工作中做不到。因為不是所有的單位都能做細菌培養，顱外做培養有時出結果要3-5天，甚至1個星期，這時病人可能不用藥都好轉，沒有必要按照這個方式用藥，一般都是經驗性用藥。絕大多數情況下，只要沒有藥物過敏問題，經驗性藥物都能起作用。