小孩胃痛最常見的原因為胃病，如胃炎與潰瘍，尤其胃炎比較常見。但是有時胃鏡進去以后，并沒有發現明顯的炎癥表現，即黏膜水腫、充血、糜爛，有時糜爛不明顯。如果是腸胃道功能有異常，稱為功能性胃腸病，即結構并無明顯異常，但是患者會感覺疼痛，這與胃腸功能有關。胃部疼痛最為常見的原因為功能性胃腸病。 有時胃痛可能是一些少見的原因或者嚴重的原因，如小兒胃痙攣導致疼痛，突然發生胃痙攣，往往原因不明。但很多胃痙攣的發生為繼發性，即患者原來有炎癥、潰瘍存在，繼發胃痙攣。其它部位的疼痛也可能被誤認為胃痛，尤其是膽道炎、膽囊炎或者膽石癥的疼痛。