腳趾甲上有裂縫原因比較多，具體如下：1、全身性的慢性疾病：如營養不良、維生素或微量元素缺乏等，影響腳趾甲根部甲母質細胞功能，進而可以導致甲板出現各種異常，包括裂縫；2、急性感染性疾病：也可以導致腳趾甲甲母質細胞功能一過性障礙，會在趾甲上留下印記，包括裂縫，可以通過相關檢查明確；3、腳趾甲局部因素：局部有皮膚癬菌等真菌感染，可以通過角蛋白酶破壞甲板結構，導致甲板出現裂縫。如果腳趾甲受外傷，也可以導致甲板受損出現裂縫。