神經中樞主要位于腦與脊髓，也稱中樞神經系統，包括大腦即端腦、間腦、腦干與小腦，大腦包括大腦皮層與皮層下白質纖維，中間基底節功能區域，大腦下面為間腦包括丘腦、下丘腦、底丘腦以及上丘腦。間腦向下連接腦干，腦干由上到下依次為中腦、腦橋、延髓，后部為小腦主要位于整個顱腔內。顱腔下面為脊髓，主要存在于脊柱中央，如頸椎內側有頸髓、胸椎內側椎管內有胸髓等。通常脊髓截止于第二腰椎，向下屬于神經結構，但脊髓包括頸髓、胸髓、腰髓、骶髓四部分。