小兒推拿對于左右手的辨別，古書上存在男左女右之分，但是現代醫學研究發現，左手或右手的刺激對身體各項反應的調節能力無明顯差別，所以臨床上通常選用孩子不愛動的一側上肢為主要刺激對象。 我國大部分人以右手為主動手，所以優先選擇左手治療。但是如果左手有相應外傷或者皮膚破損，不適于推拿，可選用右手。研究顯示在單側肢體上做穴位刺激或手法按摩，對側相應的穴位也會有感應，所以通常采用單邊治療為主。根據每個人的習慣不同或寶寶狀態不同以及不同的治療頻次，可選用不同側肢體。