小檗堿甲氧芐啶膠囊是一個復方制劑的抗菌藥物，主要成分包括小檗堿和甲氧芐啶，主要可以用于胃腸道的感染。其成分之一小檗堿是一種生物堿，對多種的病原菌都具有一定的抗菌作用，尤其對于胃腸道的感染具有比較好的抗菌作用。另外，甲氧芐啶屬于磺胺類的抗菌藥物，主要是通過干擾病原菌葉酸的合成以及利用，從而起到抗菌的活性。小檗堿甲氧芐啶膠囊對革蘭氏陽性菌、陰性菌都有一些抗菌的作用，也比較適合用于胃腸道的感染。小檗堿甲氧芐啶膠囊進入體內之后，進入血液或者是組織的比例并不高，大多數的藥品會在腸道直接發揮抗菌的作用，因此比較適合用于胃腸道的感染。在臨床上主要可以用于胃腸道感染性疾病，包括腸炎、胃腸道感染所導致的腹瀉等。在使用此藥物的時候需要注意，由于甲氧芐啶可能會干擾患者葉酸的代謝，因此應該定期監測血象，防止葉酸缺乏所導致的骨髓抑制。