活檢主要按活檢的用途決定掛的科室，如果是腫瘤性病變，可在腫瘤科進行就診。額外進行操作的科室，如超聲介入科，或者CT引導下穿刺，可根據當地科室的設置，在相應就診科室明確后續活檢流程，從而完善病理。做活檢除腫瘤方面的因素外，還有其他因素，如胃部不適或者排便等腸道不適，需進行胃鏡、腸鏡檢查。如果相關檢查發現異常可疑的病變，活檢可能直接在胃腸內科，或者鏡檢科室進行。通過病理組織，后續在病理科進行相應診斷，明確具體性質變化。除外，還有呼吸系統疾病，主要在呼吸科就診，如完善氣管鏡檢查，必要時完善活檢，均在呼吸科進行。