HPV陰性說明在檢查的當時沒有HPV的感染，而TCT則提示當時宮頸細胞的情況，所以HPV陰性，TCT仍然是會有問題的。這不僅與曾經是否有過HPV感染有關，同時也與機體的狀態、宮頸的問題有密切的關系。雖然絕大多數的宮頸癌都與HPV的感染有關，但是宮頸的癌癥，特別是宮頸的鱗癌，有極少數人與早婚、早育、多產有關。這類患者HPV不一定有陽性的表現，而TCT則會有異常的情況。這種情況雖然比較少，但是也時有發生。另外HPV是可以通過抵抗力來清除的，但是如果曾經有HPV的感染，宮頸也會出現問題。可見HPV陰性，TCT仍然會有問題，在做宮頸癌篩查時最好二者同時進行。