激光治療近視眼主要是削去角膜基質層。角膜組織最厚的部分叫角膜基質層，治療近視眼削去的部位就在角膜基質層，瞳孔區域，大概直徑在3-4mm之間的范圍。角膜主要是指眼球的黑眼珠，黑眼珠的厚度大概在0.5cm，一般分成5層。最表面的一層叫角膜上皮，角膜上皮的底下或者深部叫前彈力層，前彈力層的后邊是角膜基質層，角膜的基質層到后面叫后彈力層，后彈力層最里面的叫角膜內皮。角膜厚度的90%是基質層，基質層是很規律排列的透明板層組織，激光削切角膜基質層的這些組織，削切一部分后，角膜上皮就會覆蓋長入這個部分，對眼睛的影響很小。眼睛由于角膜上皮或者前彈力層的覆蓋，沒有任何感覺，一般手術1-2個月以后，恢復正常。同時通過削切基質層改變眼睛角膜的屈光狀態，通過光線的折射或者聚焦，原來的近視度數可以完全綜合地治療好。