乙肝五項是乙肝三系檢測，乙肝三系反映病毒復制情況，其陰性、陽性，從機體的免疫應答情況來側面反映病毒在體內是否存在。所以乙肝三系或者乙肝五系陰性，提示沒有感染過乙肝。但是少數人群約5％-10％，在隱匿性乙肝感染時，乙肝三系也是陰性，所以這時要結合檢測血中的乙肝DNA進一步排除乙肝感染。 少數患者處于窗口期，窗口期是抗體和抗原量相等，結合時不能檢測到乙肝三系，過一周或者兩周再檢測時，就有陽性。所以窗口期患者有可能是乙肝三系陰性，特別是急性感染時，故乙肝三系陰性多數情況下提示患者沒有感染乙肝。