兒童過敏性結膜炎目前常用的藥物主要是肥大細胞穩定劑，代表藥物是色甘酸鈉，在早期因為起作用時間比較慢，可能7天以后才起作用，所以早期用上幾天之后沒有效果。另外是抗組胺藥物，起效時間非?？?，但是持續時間比較短，所以產生了第三種藥，既有抗組胺，又有肥大細胞穩定效果的作用，代表藥物是氮卓斯丁和帕坦洛兩種藥物。除此之外還有些抗炎的藥物，比如激素類的抗炎藥和非甾體類的抗炎藥，主要是在減輕炎癥反應方面起作用。此外在過敏性結膜炎的治療過程中，可能會用到一些人工淚液，人工淚液的主要作用是能夠緩解過敏性結膜炎引起的眼部干澀的癥狀，同時起到沖洗的作用，能夠使眼部表面的過敏原和炎癥因子沖洗掉，從而達到一定的治療和緩解眼癢、眼部充血癥狀的作用。